Shotgun Metagenomic Sequencing چیست؟
توالی‌یابی متاژنومیک شاتگان (Shotgun Metagenomic Sequencing) امکان تحلیل جامع کل محتوای DNA ژنومی موجود در یک نمونه زیستی را بدون نیاز به جداسازی، کشت میکروارگانیسم‌ها یا تقویت نواحی خاص ژنومی، فراهم می‌سازد. این رویکرد بسیار حائز اهمیت است، چرا که حدود 99% از میکروارگانیسم‌ها در شرایط آزمایشگاهی قابلیت کشت ندارند و تنها از طریق روش‌های مبتنی بر متاژنومیک می‌توان آن‌ها را شناسایی و بررسی کرد. برخلاف رویکرد هدفمند مورد استفاده در توالی‌یابی آمپلیکونی 16S/18S/ITS، توالی‌یابی متاژنومیک شاتگان با بهره‌گیری از فناوری توالی‌یابی نسل بعدی (NGS)، نه‌تنها امکان شناسایی تاکسونومیک دقیق‌تر ارگانیسم‌ها را فراهم می‌سازد، بلکه اطلاعات جامع‌تری از جمله پروفایل‌های عملکردی، پیش‌بینی ژن‌ها و تحلیل تعاملات میکروبی در کل جامعه میکروبی را نیز ارائه می‌دهد.
با تجربه گسترده و فناوری‌های بیوانفورماتیکی پیشرفته، خدمات Novogene می‌توانند به شما در شناسایی ژنوم‌ها، عملکردها و تغییرات میکروارگانیسم‌ها از نمونه‌های مختلف کمک کنند. خدمات توالی‌یابی متاژنومیک شاتگان داده‌های با کیفیت بالا، نتایج آماده برای انتشار و تحلیل‌های شخصی‌سازی‌شده را ارائه می‌دهند.
کاربردها
از پروفایل‌سازی تاکسونومیک تا تحلیل عملکرد و شبکه‌های متابولیکی، توالی‌یابی متاژنومیک شاتگان می‌تواند در بسیاری از موضوعات، مورد استفاده قرار گیرد، از جمله:
● حاشیه‌نویسی ترکیب و عملکرد میکروبی
● شناسایی میکروب‌های مورد علاقه مرتبط با سلامت انسان، بازیابی محیط زیست و سنتز انرژی
● بررسی رابطه میکروب - میزبان، تحقیق عمیق در مورد ساختار ژنتیکی و متابولیسم میکروب‌ها برای تولید دارو
مزیت‌ها
● توالی‌یابی متاژنومیک شاتگان می‌تواند برای توالی‌یابی چندین میکروارگانیسم در یک اجرای واحد استفاده شود، بدون نیاز به ایزوله‌سازی و پرورش خاص میکروارگانیسم‌ها یا تقویت نواحی هدف برای پروکاریوت‌ها یا یوکاریوت‌ها. نتایج توالی‌یابی اطلاعات کاملی نه تنها در مورد تنوع میکروبی، بلکه همچنین در مورد تنوع عملکردی در نمونه فراهم می‌کنند.
ویژگی‌های خدمت
Metagenomic Specifications: DNA Sample Requirements
| Sample Type | Amount | Volume | Concentration | Purity |
| Total DNA | ≥ 200 ng | ≥20 μL | ≥ 10 ng/μL | A260/280 = 1.8-2.0 |
Metagenomic Specifications: Sequencing and Analysis
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq 6000 |
| Read Length | Pair-end 150 bp |
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 40 million read pairs per sample for species with reference genome |
| Standard Data Analysis |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
به‌منظور تضمین دقت و قابلیت اعتماد داده‌های توالی‌یابی، کنترل کیفیت (QC) مطابق با استانداردهای علمی بالا در هر مرحله از فرایند انجام می‌شود. روند کاری توالی‌یابی متاژنومیک شاتگان شامل مراحل اصلی آماده‌سازی و اندازه‌گیری نمونه، قطعه‌قطعه کردن و تهیه کتابخانه، کنترل کیفیت کتابخانه، توالی‌یابی و تحلیل‌های بیوانفورماتیکی است.
