RNA Immunoprecipitation Sequencing (RIP-Seq)
توالی‌یابی RIP-Seq یک روش توالی‌یابی RNA با توان بالا است که به‌طور گسترده برای مطالعه تعاملات پروتئین-RNA و شناسایی ارتباط RNAها با پروتئین‌های هدف استفاده می‌شود. ترکیب RIP-Seq با دیگر فناوری‌های توالی‌یابی، امکان شناسایی تعداد زیادی از کمپلکس‌های RNA-پروتئین را در یک فرایند فراهم می‌کند. این روش علاوه بر ارائه بینش عمیق در مورد اصول اساسی زیست‌شناسی مولکولی (مانند رونویسی و ترجمه)، در حوزه‌های جدیدی نظیر تنظیم ژن توسط ncRNAها و RNA interference نیز کاربرد دارد.
کاربردهای RIP-Seq
● بررسی و تایید تعاملات بین RNAها و پروتئین‌های هدف.
● شناسایی شبکه‌های ژنومی از تعاملات RNA با پروتئین‌های متصل به RNA.
● تحلیل تعاملات بین RBPها و RNAهای غیرکدکننده (ncRNA)، RNAهای بلند غیرکدکننده (lncRNA) و میکرو RNAها (miRNA).
مزیت‌های RIP-Seq
● RIP-Seq در تفسیر شبکه تعاملات RNA-RBP با توجه به ncRNAها مانند lncRNA و miRNA بسیار متنوع است.
● در مقایسه با CLIP-Seq، نیاز به UV-crosslinking ندارد که فرایند را ساده‌تر و نتایج را دقیق‌تر می‌سازد.
● پوشش وسیع این روش امکان شناسایی و تعیین دقیق سایت‌های اتصال پروتئین در سراسر ژنوم را فراهم می‌کند.
● ترکیب فناوری با وضوح بالا و توان عملیاتی بالا، شناسایی سایت‌های اتصال پروتئین جدید را ممکن می‌سازد.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: RNA Sample Requirements
| Sample Type | Required Amount | Peaks Distribution | Purity |
| Enriched RNA Sample | ≥ 100 ng (Concentration ≥ 3 ng/μL) |
For unfragmented sample, fragment should be ≥ 1000 bp. |
A260/280>2.0 |
Specifications: Sequencing and Analysis
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq 6000 Sequencing System |
| Read Length | Paired-end 150bp |
| Recommended Data Amount | ≥ 20 million read pairs per sample for the species with a reference genome |
| Content of Data Analysis |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
خدمات RIP-seq شرکت Novogene شامل چهار مرحله است: آماده‌سازی نمونه، آماده‌سازی کتابخانه RNA، توالی‌یابی با دستگاه Illumina PE150 و تحلیل داده‌ها با استفاده از pipelineهای بیوانفورماتیکی. تمامی مراحل شامل کنترل کیفی نمونه، کنترل کیفی کتابخانه و کنترل کیفی داده‌های توالی‌یابی با دقت بالا بررسی می‌شوند.
