Prokaryotic RNA Sequencing چیست؟
توالی‌یابی RNA پروکاریوتی از فناوری توالی‌یابی نسل جدید با توان پردازش بالا (NGS) برای توالی‌یابی ترنسکریپتوم پروکاریوتی استفاده می‌کند و به‌طور سریع و سیستماتیک داده‌های تمامی ترنسکریپت‌ها (mRNA کدکننده و غیرکدکننده) را به‌دست می‌آورد.
توالی‌یابی RNA پروکاریوتی با استفاده از یک کتابخانه RNA استرند شده، پروفایل ترنسکریپتوم را ارائه می‌دهد که تخمینی دقیق‌تر از بیان ترنسکریپت‌ها را در اختیارمان می‌گذارد.
کاربردها
● پروفایل کردن ترنسکریپت‌ها در پروکاریوت‌ها
● پیش‌بینی اپرون‌ها، TSS، پروموتر و UTR
● پروفایل کردن ترنسکریپت‌ها در پروکاریوت‌ها
● کشف مکانیسم‌های تنظیم RNA از طریق پیش‌بینی ترنسکریپت‌های آنتی‌سن و تحلیل sRNA
مزیت‌ها
Novogene در ساخت کتابخانه‌های RNA پروکاریوتی از روش‌های حذف rRNA استفاده می‌کند. این روش‌های موثر حذف، برای طیف وسیعی از گونه‌ها به‌کار گرفته شده‌اند.
علاوه بر کمی‌سازی بیان ژن، تحلیل‌های متعددی در زمینه ساختار و عملکرد ژن نیز در تحلیل‌های استاندارد گنجانده شده‌اند. همچنین امکان طراحی تحلیل‌های سفارشی برای توالی‌یابی RNA پروکاریوتی وجود دارد.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: RNA Sample Requirements
| Library Type | Sample Type | Amount | RNA Integrity Number (Agilent 2100) |
Purity (NanoDrop) |
| Prokaryotic RNA Library | Total RNA | ≥ 500 ng | ≥ 6.0, smooth base line | A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0 |
Specifications:Sequencing and Analysis
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq 6000 Sequencing System |
| Read Length | Paired-end 150bp |
| Recommended Data Amount | ≥ 2Gb raw data per sample for the species with reference genome |
| Customized Data Analysis |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
اولین مرحله از روند پروژه شامل کنترل کیفیت نمونه‌ها (Sample QC) است تا اطمینان حاصل شود که نمونه‌ها معیارهای تکنیک RNA-Seq را دارند. سپس کتابخانه مناسب طبق ارگانیسم هدف ساخته و کیفیت آن آزمایش می‌شود (Library QC). در مرحله بعد، استراتژی توالی‌یابی جفتی 150 جفت باز برای توالی‌یابی نمونه‌ها استفاده می‌شود و داده‌های حاصل از آن تحت کنترل کیفیت داده‌ها (Data QC) قرار می‌گیرد تا از کیفیت داده‌های نهایی اطمینان حاصل شود.
