Circular RNA Sequencing چیست؟
RNA دایره‌ای (circRNA) یک مولکول ncRNA بسیار پایدار بوده که به‌صورت یک حلقه بسته کووالانسی تشکیل شده و فاقد کلاهک 5' و دنباله‌های پلی(A) 3' است. ساختار دایره‌ای circRNAها، آن‌ها را در برابر هضم با اگزونوکلئاز مقاوم می‌سازد، یک ویژگی که می‌توان از آن در ساخت کتابخانه بهره برد.
خدمات توالی‌یابی RNA دایره‌ای (circRNA-seq) با استفاده از فناوری توالی‌یابی نسل جدید (NGS) طیف گسترده‌ای از تحقیقات متمرکز بر circRNA را پشتیبانی می‌کند. عملکرد تنظیمی circRNAها ممکن است در بسیاری از فرایندهای زیستی نقش داشته باشد، از جمله تنظیم بیان ژن از طریق عمل به‌عنوان «اسفنج» برای miRNAها، حمل‌ونقل miRNAها و تنظیم کلی سنتز پروتئین.
کاربردها
توالی‌یابی RNA دایره‌ای (circRNA-seq) اهمیت مولکولی آن را در تنظیم بیان ژن آشکار می‌سازد، از جمله:
● پروفایل‌سازی circRNAهای شناخته‌شده و جدید و پیش‌بینی ژن‌های هدف.
● شناسایی بیومارکرها برای تشخیص و طبقه‌بندی بیماری‌ها
● بررسی شبکه‌های تنظیمی بین ncRNA و miRNA.
● درک مکانیسم‌های توسعه بافت یا ارگانیسم بر اساس پروفایل‌های رونویسی.
مزیت‌ها
● خدمات توالی‌یابی circRNA شرکت Novogene بر پایه تجربه گسترده‌ای استوار است که از تحقیقات بسیاری از محققان پشتیبانی کرده است. این خدمات تحلیل جامعی را با استفاده از نرم‌افزارهای استاندارد صنعتی و یک پایپ‌لاین بیوانفورماتیکی پیشرفته داخلی ارائه می‌دهد. Novogene راه‌حلی سریع و کارآمد برای کمک به محققان در درک شبکه‌های تنظیمی و مکانیزم‌های عمیق تنظیم بیان ژن فراهم می‌کند.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: RNA Sample Requirements
| Library Type | Sample Type | Amount | RNA Integrity Number (Agilent 2100) | Purity (NanoDrop) |
| circRNA Library | Total RNA | ≥ 2 μg | Animal ≥ 7, Plant ≥ 6.5, with smooth baseline | OD260/280 ≥ 2.0; OD260/230 ≥ 2.0; no degradation, no contamination |
Specifications: Sequencing and Analysis
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq 6000 |
| Read Length | Paired-end 150bp |
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 40 million read pair per sample |
| Standard Data Analysis |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
این فرایند با ارزیابی کیفیت نمونه‌ها آغاز می‌شود. پس از حذف RNA ریبوزومی (rRNA)، نمونه‌ها توسط آنزیم RNase R هضم شده تا رونویس‌های خطی حذف شوند. کتابخانه‌های رشته - ویژه (کتابخانه‌های جهت‌دار) تهیه می‌شوند و توالی‌یابی با استفاده از استراتژی جفت‌باز 150 نوکلئوتیدی انجام می‌گردد. ارزیابی کیفیت نمونه‌ها، کتابخانه‌ها و داده‌های توالی‌یابی برای تضمین نتایج با کیفیت بالا انجام می‌شود.
