Long Non-coding RNA Sequencing چیست؟
RNAهای بلند غیرکدکننده (lncRNAs) بخش قابل توجهی از ترانسکریپتوم یوکاریوت‌ها را تشکیل می‌دهند. این RNAها شامل مولکول‌های غیرکدکننده‌ای با طول بیش از 200 نوکلئوتید (ncRNAs) هستند، از جمله lincRNAs (lncRNAهای بین‌ژنی)، RNAهای درون‌ژنی (intronic)، ضدحس (anti-sense)، حس (sense) و دوطرفه (bidirectional) که هیچ پروتئینی را کد نمی‌کنند. lncRNAها از طریق تنظیم رونویسی ژن، تغییرات پسارونویسی و اپی‌ژنتیک بر عملکردهای مختلف سلولی تاثیر می‌گذارند. تکنیک توالی‌یابی lncRNA (lncRNA-seq) یک ابزار قدرتمند NGS برای مطالعه نقش‌های عملکردی در فرایندهای زیستی متنوع و بیماری‌های انسانی مانند سرطان و اختلالات عصبی است.
خدمات توالی‌یابی lncRNA شرکت Novogene با سیستم پیشرفته آماده‌سازی کتابخانه، امکان غنی‌سازی اطلاعات و پروفایل‌سازی بیان ژن برای رونویس‌های کدکننده و غیرکدکننده را از یک دیدگاه حساس‌تر ترانسکریپتومی فراهم می‌کند. با استفاده از تحلیل‌های بیوانفورماتیکی، جهت‌گیری رشته و ارتباط تنظیمی بین lncRNA و mRNA هدف مورد بررسی قرار می‌گیرد و همه این تحلیل‌ها تنها در یک مرحله انجام می‌شود.
کاربردها
توالی‌یابی lncRNA (lncRNA-seq) افق‌های جدید و هیجان‌انگیزی برای پژوهش‌ها ایجاد کرده است، از جمله:
● پروفایل‌سازی رونویس‌های شناخته‌شده و جدید و شناسایی تغییرات آن‌ها.
● پیش‌بینی ژن‌های هدف برای lncRNA.
● شناسایی نشانگرهای زیستی برای تشخیص و طبقه‌بندی سرطان / بیماری‌ها.
● کشف تنظیمات میان lncRNA و mRNA.
مزیت‌ها
● خدمات lncRNA-seq شرکت Novogene با خروجی بالا و دقت بالا (امتیاز Q30 ≥ 85%) ارائه می‌شود و تنها به مقدار کمی RNA اولیه نیاز دارد. Novogene با تکمیل هزاران پروژه موفق، تجربه گسترده‌ای در ارائه خدمات RNA-Seq دارد و به پژوهشگران بسیاری کمک کرده است تا مقالات خود را در مجلات معتبر بالا منتشر کنند.
● Novogene راه‌حل‌های جامعی برای شناسایی، کمی‌سازی، تحلیل بیان تفاضلی، تحلیل غنی‌سازی، پیش‌بینی ژن‌های جدید و پیش‌بینی اهداف lncRNA ارائه می‌دهد.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: RNA Sample Requirements
| Library Type | Sample Type | Amount | RNA Integrity Number (Agilent 2100) | Purity (NanoDrop) |
| lncRNA Library | Total RNA | ≥ 500 ng | Animal ≥ 6.5, Plant ≥ 6, with smooth baseline |
A260/280 = 1.8-2.2 A260/230 ≥ 1.8 |
| Exosomal lncRNA Library | Exosomal RNA | ≥ 5 ng | Peak between 25-200 nt, FU> 10, no peak > 2000 nt |
|
| Dual RNA library | Total RNA | ≥ 1 μg | ≥ 6.5, with flat base line |
Specifications: Sequencing and Analysis
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq 6000 |
| Recommended Data Output | ≥ 40 million read pairs per sample |
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 40 million read pairs per sample for species with reference genome |
| Standard Data Analysis |
Data Quality Control Structural Analysis (Alternative Splicing & Variation Calling) lncRNA Identification & Annotation Expression Quantification & Differential Expression Profiling Functional Enrichment Analysis Protein-Protein Interaction (PPI) analysis lncRNA Target Gene Prediction |
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
جریان کاری توالی‌یابی lncRNA با آماده‌سازی نمونه و کنترل کیفیت آغاز می‌شود. برای غنی‌سازی رونویس‌های هدف، RNA ریبوزومی (rRNA) حذف شده و RNA تکه‌تکه‌شده به کمک ترانسکریپتاز معکوس به cDNA تبدیل می‌گردد. در ادامه، کتابخانه‌های اختصاصی رشته (جهت‌دار یا رشته‌ای) آماده‌سازی می‌شوند و توالی‌یابی با استفاده از فناوری دوطرفه 150 جفت باز (Paired-End 150bp) بر روی پلتفرم Illumina انجام می‌شود. پردازش داده‌ها از طریق Pipeline های استاندارد و پیشرفته Novogene انجام شده و بالاترین کیفیت نتایج را تضمین می‌کند.
