Animal and Plant De novo Sequencing چیست؟
توالی‌یابی De novo به تولید توالی ژنومی اولیه یک موجود بدون استفاده از توالی مرجع می‌پردازد. این روش امکان شناسایی تغییرات پیچیده ژنومی مانند Indel ،CNV و SV را فراهم می‌کند و در مطالعات تکامل، تاریخچه جمعیتی، اصلاح نژاد کشاورزی و شناسایی تغییرات ژنتیکی بسیار ارزشمند است.
با تجربه گسترده در عملیات‌های آزمایشگاهی و تحلیل‌های بیوانفورماتیکی، شرکت Novogene مشخصه‌سازی دقیق، سریع و جامع گونه‌ها را ارائه داده و نتایج قابل اعتمادی را ارائه می‌کند. علاوه بر این، خدمات جامع و یکپارچه Novogene زمان تحویل فوق‌العاده سریعی را به ارمغان می‌آورند.
از کاربردهای توالی‌یابی De novo در تحقیقات فردی می‌توان به راهنمایی در زمینه اصلاح نژاد ژنتیکی حیوانات، ارائه مبنای نظری برای غربالگری داروها، کشف منابع دارویی و نوآوری در گونه‌ها اشاره کرد؛ در پژوهش‌های جمعیتی، توالی‌یابی De novo کارکردهایی نظیر بررسی منشأ و تکامل گونه‌ها و همچنین ارائه دیدگاه‌های جدید درباره الگوهای واگرایی ژنومی را داراست.
مزیت‌ها
● تجربه بالا: پژوهشگران برجسته Novogene پروژه‌های بزرگ توالی‌یابی De novo ژنوم را با موفقیت به پایان رسانده و داده‌های خود را در مجلات معتبر علمی منتشر کرده‌اند.
● تخصص در بیوانفورماتیک: از نرم‌افزارهای پیشرفته و شناخته‌شده‌ای مانند Falcon و Canu برای تحلیل‌های جامع بیوانفورماتیکی در گیاهان و حیوانات استفاده می‌شود.
● استراتژی‌های متنوع: با ترکیب نتایج توالی‌یابی از پلتفرم‌های مختلف از جمله Illumina Novaseq ،PacBio Revio / Sequel II/Sequel IIe و Oxford PromethION، بهترین راه‌حل‌های Assembly را متناسب با هر ژنوم منحصربه‌فرد ارائه می‌دهیم.
● کیفیت بی‌نظیر داده‌ها: ما تضمین می‌کنیم که امتیاز Q30 در داده‌های تولیدی ≥ 85% باشد، که از تضمین رسمی Illumina (≥ 75%) بالاتر است.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: DNA Sample Requirements
| Platform Type | Sample Type | Amount (Qubit®) | Purity |
| Illumina NovaSeq 6000 |
Genomic DNA | ≥ 200 ng | A260/280=1.8-2.0; no degradation, no contamination |
| Genomic DNA (PCR free non-350bp) |
≥ 5 μg | ||
| Genomic DNA (PCR free -350bp) |
≥ 1.2 μg | ||
| PacBio Sequel II DNA CLR library |
HMW Genomic DNA | ≥ 5 μg (Concentration ≥ 70 ng/μL) |
A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.5-2.6; NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb |
| PacBio Revio/sequel II/sequel IIe DNA HiFi library | HMW Genomic DNA | ≥ 15 μg (Concentration ≥ 70 ng/μL) |
A260/280=1.8-2.0; A260/230=1.5-2.6; NC/QC=1.00-2.20 Fragments should be ≥ 30 kb |
| Nanopore PromethION | HMW Genomic DNA | ≥ 8 μg (Concentration ≥ 100 ng/μL) |
A260/280=1.75-2.0; A260/230=1.4-2.6; NC/QC=0.95-3.00 Fragments should be ≥ 30 kb |
* NC/QC: NanoDrop concentration/Qubit concentration
Specifications: Sequencing and Analysis
| Sequencing Parameters | Illumina Novaseq 6000 | PacBio Revio/sequel II/sequel IIe | Nanopore PromethION |
| Read Length | Paired-end 150 bp | ||
| Recommended Sequencing Depth | For genome survey or assembly polishing: ≥ 50× | For genome assembly: ≥ 50× | |
|
Standard Analysis
|
|
|
|
| Genome Annotation | － |
|
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
از آماده‌سازی نمونه، تهیه کتابخانه، توالی‌یابی کوتاه‌خوان و بلند‌خوان، کنترل کیفیت داده‌ها، تا تحلیل‌های بیوانفورماتیکی، Novogene محصولات با کیفیت بالا و خدمات حرفه‌ای ارائه می‌دهد. هر مرحله با رعایت استانداردهای علمی بالا و طراحی دقیق انجام می‌شود تا اطمینان حاصل شود که نتایج تحقیقاتی با کیفیت بالا به دست آید.
