Target Capture Sequencing چیست؟
Target Capture Sequencing یکی از روش‌های پیشرفته در حوزه تعیین توالی (Sequencing) است که به منظور مطالعه بخش‌های خاصی از ژنوم مورد استفاده قرار می‌گیرد. این روش به شما این امکان را می‌دهد که به جای تعیین توالی کل ژنوم (WGS)، فقط نواحی خاص و مرتبط با مقصود تحقیقاتی خود را هدف‌گیری کرده و آن‌ها را تعیین توالی کنید. این روش ترکیبی از تکنیک‌های بیوشیمی و بیوانفورماتیک است.
مراحل Target Capture Sequencing
آماده‌سازی کتابخانه
ابتدا DNA یا RNA از نمونه استخراج می‌شود و به قطعات کوچکتر شکسته می‌شود. سپس، این قطعات به یک کتابخانه توالی‌یابی تبدیل می‌شوند، که شامل افزودن آداپتورهایی (Adapters) به انتهای هر قطعه است. این آداپتورها در مراحل بعدی برای شناسایی و تقویت توالی‌ها استفاده می‌شوند.
طراحی پروب‌های هدف
پروب‌ها یا الیگونوکلئوتیدهای مکمل برای نواحی هدف طراحی می‌شوند. این پروب‌ها معمولاً به مواد مغناطیسی یا بیوتین متصل می‌شوند تا امکان جداسازی فراهم شود. نواحی هدف شامل ژن‌ها، اگزون‌ها یا نواحی غیرکدکننده هستند.
غنی‌سازی نواحی هدف
کتابخانه تولیدشده با پروب‌های طراحی‌شده انکوبه می‌شود. این پروب‌ها به طور اختصاصی به توالی‌های هدف متصل می‌شوند، در حالی که سایر بخش‌های غیرهدف در طول فرایند شستشو، حذف می‌گردند. نتیجه این مرحله یک مجموعه غنی از توالی‌های موردنظر برای تعیین توالی است.
شستشو و تقویت
پس از جداسازی توالی‌های هدف، آن‌ها از پروب‌ها جدا شده (Eluted) و برای افزایش غلظت به اندازه کافی تقویت (Amplified) می‌شوند. این تقویت معمولاً با استفاده از تکنیک‌هایی نظیر PCR انجام می‌شود و هدف آن تولید مقدار کافی از توالی‌های هدف برای تعیین توالی دقیق در مراحل بعدی است. این فرایند همچنین به کاهش خطا و حذف هرگونه آلودگی احتمالی کمک می‌کند.
تعیین توالی
در این مرحله، نواحی غنی‌شده و تقویت‌شده با استفاده از فناوری‌های پیشرفته تعیین توالی نظیر Illumina ،Ion Torrent یا PacBio مورد بررسی قرار می‌گیرند. دستگاه تعیین توالی با خواندن هزاران تا میلیون‌ها قطعه DNA به طور موازی، اطلاعات خام توالی را به صورت داده‌های دیجیتال تولید می‌کند. این داده‌ها شامل توالی بازهای DNA (A ،T ،C ،G) است و پایه‌ای برای تحلیل‌های بیوانفورماتیکی دقیق در مراحل بعدی فراهم می‌کند.
تحلیل داده‌ها
داده‌های خام تولیدشده، پردازش می‌شوند تا خطاها حذف و توالی‌ها با ژنوم مرجع هم‌ردیف شوند. سپس، جهش‌ها، تغییرات ساختاری و سایر واریانت‌ها شناسایی و تفسیر می‌شوند. این مرحله با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی پیشرفته انجام می‌شود تا اطلاعات ژنتیکی دقیق و کاربردی استخراج شود. هدف از این مرحله، استخراج اطلاعات بیولوژیکی معنی‌دار از داده‌های خام و تفسیر دقیق نتایج برای پاسخ به سوالات تحقیقاتی است.
انواع خدمات Target Capture Sequencing
لطفاً نوع خدمت مورد نظر خود را در زیر انتخاب نمایید.
پلتفرم Sequencing
ILLUMINA NOVASEQ PLATFORM
NovaSeq 6000
● امکان توالی‌یابی 64 ژنوم انسانی (با سایز 90GB) و تولید حداکثر 6Tb داده در هر اجرا در بازه زمانی کمتر از 40 ساعت.
● 850G داده خام در هر لاین، 3.4T داده خام در هر فلوسل و طول خوانش 150 جفت باز (2 × 150 bp).
● 800M خوانش خام در هر فلوسل با طول خوانش‌های 2 × 250 bp و 2 × 50 bp.
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه‌ها
گواهی اصالت از شرکت Novogene
