Direct RNA Sequencing چیست؟
توالی‌یابی مستقیم RNA یا (Direct RNA Sequencing) امکان خواندن مداوم و بومی ترنسکریپت‌های RNA کامل را بدون نیاز به تبدیل معکوس (Reverse Transcription) یا تقویت با PCR فراهم می‌کند. برخلاف روش‌های سنتی توالی‌یابی RNA که RNA را به DNA مکمل (cDNA) تبدیل می‌کنند، توالی‌یابی مستقیم RNA، نمایشی دقیق از مولکول‌های RNA بومی ارائه می‌دهد و تغییرات شیمیایی مانند متیلاسیون که در روش‌های دیگر از بین می‌روند را حفظ می‌کند.
این روش با فناوری Nanopore انجام می‌شود و کل ترنسکریپت‌ها، از ناحیه 5’UTR تا انتهای پلی‌آدنیله (3’poly-A tail) را به‌طور مستقیم شناسایی می‌کند. این فناوری به پژوهشگران اجازه می‌دهد تا ساختار واقعی، طول زنجیره‌های پلی‌آدنیله و تغییرات مولکولی ترنسکریپت‌ها مانند 5-متیل‌سیتوزین (5mC) و N6-متیل‌آدنوزین (m6A) را کشف کنند. توانایی شناسایی تغییرات پسارونویسی، مسیرهای جدیدی را برای درک زیست‌شناسی RNA، به‌ویژه در مطالعه عناصر تنظیمی و دینامیک عملکردی ترنسکریپتوم، فراهم می‌کند.
کاربردها
● بررسی نقش تغییرات RNA در تنظیم ژن‌ها و مکانیسم‌های بیماری.
● تخمین طول زنجیره‌های پلی‌آدنیله برای مطالعه تنظیم بیان ژن در سطح پسارونویسی، مانند کارایی ترجمه، پایداری RNA، پاسخ‌های سلولی و اختلالات مرتبط با بیماری.
● شناسایی ایزوفرم‌های جدید برای درک جایگزینی‌های اسپلایسینگ، پلی‌آدنیلاسیون و ویرایش RNA، که پیچیدگی بیان ژن را آشکار می‌کند.
● پروفایل‌سازی فراوانی ترنسکریپت در بافت‌ها، شرایط یا درمان‌های مختلف برای پشتیبانی از مطالعات تنظیم بیان ژن.
مزیت‌ها
● توالی‌یابی RNA بومی: بدون آرتیفکت‌های ناشی از تبدیل معکوس یا تقویت، نتایج دقیق‌تری ارائه می‌دهد.
● تشخیص مستقیم تغییرات RNA: شناسایی تغییرات مهم RNA مانند متیلاسیون که نقش حیاتی در تنظیم ژن‌ها دارند.
● توالی‌یابی بلندخوان: امکان خواندن ترنسکریپت‌های کامل RNA و کشف ایزوفرم‌های جدید و تحلیل دقیق واریانت‌های ترنسکریپت.
● پروفایل‌سازی جامع ترنسکریپتوم: بینش‌های عمیقی در ترنسکریپتوم‌های پیچیده، پشتیبانی از تحقیقات در مکانیسم‌های بیماری، بیان ژن و زیست‌شناسی RNA ارائه می‌دهد.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: RNA Sample Requirements
| Library Type | Sample Type | Amount* | RNA Integrity Number (Agilent 2100) |
Purity (NanoDrop) |
| Nanopore Direct RNA library | Total RNA (Animal) |
≥ 20 μg | ≥ 6.5, with smooth base line | A260/280 = 1.8-2.2 A260/230 ≥ 1.3-2.5 |
| Total RNA (Plant & Fungus) |
≥ 50 μg | ≥ 6.5, with smooth base line | A260/280 = 1.8-2.2 A260/230 ≥ 1.3-2.5 |
Specifications: Sequencing and Analysis
| Sequencing Platform | Nanopore PromethION |
| Sequencing depth | 10M~20M reads/sample (1 PromethION cell/ sample) |
| Customized Data Analysis |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
Novogene در تمامی مراحل گردش کار پروژه، محصولات باکیفیت و خدمات تخصصی ارائه می‌دهد. هر مرحله با دقت طراحی و اجرا می‌شود تا با رعایت استانداردهای علمی سختگیرانه، نتایج پژوهشی بی‌نظیری تضمین گردد. برای اطمینان از دقت و قابلیت اطمینان داده‌های توالی‌یابی، اقدامات سختگیرانه کنترل کیفیت (QC) در هر مرحله از فرایند اعمال می‌شود. این گردش کار شامل مراحل کلیدی مانند آماده‌سازی و اندازه‌گیری نمونه، تکه‌تکه‌سازی و آماده‌سازی کتابخانه، کنترل کیفیت کتابخانه، توالی‌یابی و تحلیل بیوانفورماتیکی است.
