mRNA Sequencing (mRNA-seq) چیست؟
توالی‌یابی RNA پیام‌رسان یا mRNA Sequencing (mRNA-seq) یکی از پیشرفته‌ترین روش‌های تحلیل بیان ژن در سطح ترنسکریپتوم است. این تکنیک با استفاده از فناوری توالی‌یابی نسل جدید (NGS)، امکان شناسایی و اندازه‌گیری دقیق سطح بیان ژن‌ها را فراهم می‌کند. در این روش، تنها mRNAهای دارای دنباله پلی‌آ (Poly-A) جداسازی و به cDNA تبدیل می‌شوند تا توالی‌یابی روی آن‌ها صورت گیرد.
mRNA-seq به دلیل حساسیت بالا و توان تفکیک دقیق، به عنوان یک ابزار کلیدی در مطالعات ژنتیکی، بیولوژی مولکولی و پزشکی شخصی مورد استفاده قرار می‌گیرد.
کاربردهای mRNA Sequencing
بررسی الگوهای بیان ژن در شرایط فیزیولوژیک و پاتولوژیک
شناسایی ژن‌های دیفرانسیلی بین بافت‌های سالم و بیمار
تحلیل مسیرهای زیستی (Pathway Analysis) و شبکه‌های تنظیمی
درک مکانیسم‌های مولکولی بیماری‌ها مانند سرطان، بیماری‌های عصبی و التهابی
ارزیابی اثربخشی داروها یا پاسخ به درمان
مطالعه بیان ژن در طول فرایندهای تکوینی یا تمایز سلولی
مزایای تکنولوژی mRNA-seq
تفکیک بالا برای شناسایی دقیق سطح بیان ژن‌ها
عدم وابستگی به توالی مرجع (برای گونه‌های کمتر شناخته‌شده)
امکان کشف ترنسکریپت‌های جدید، ایزوفرم‌ها و Splice Variants
مناسب برای نمونه‌های با کیفیت و مقدار پایین
قابل استفاده در انواع نمونه‌های سلولی، بافتی یا حتی تک‌سلولی
جمع‌بندی
mRNA-seq یکی از ابزارهای تحول‌آفرین در ژنومیک عملکردی است که با دقت بالا و انعطاف‌پذیری در طراحی آزمایش‌ها، امکان پاسخ‌گویی به پرسش‌های پیچیده در حوزه‌های زیست‌پزشکی، داروسازی و بیوتکنولوژی را فراهم می‌کند. این روش هم‌اکنون در خط مقدم تحقیقات علمی قرار دارد و نقش محوری در توسعه درمان‌های هدفمند و پزشکی دقیق ایفا می‌کند.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: Sample Requirements
| Library Type | Sample Type | Amount | RNA Integrity Number (Agilent 2100) | Purity (NanoDrop) |
| Eukaryotic RNA-Seq (cDNA library) | Total RNA | ≥ 200 ng | ≥ 4.0, with smooth base line | A260/280 = 1.8-2.2 A260/230 ≥ 1.8 |
| Total RNA (Blood) | ≥ 400 ng | ≥ 5.8, with smooth base line | ||
| Amplified cDNA (double-stranded) | ≥ 100 ng | Fragments between 400bp and 5000bp with main peak at ~2000bp | A260/280 = 1.8-2.0 A260/230 ≥ 1.8 |
|
| Eukaryotic RNA-Seq (strand specific library) | Total RNA | ≥ 400 ng | ≥ 5.8, with smooth base line | A260/280 = 1.8-2.2 A260/230 ≥ 1.8 |
Specifications: Sequencing and Analysis
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq 6000 Sequencing System |
| Read Length | Paired-end 150 bp |
| Data Output |
|
| Data Analysis Capability |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
فرایند پروژه با انجام کنترل کیفیت اولیه روی نمونه‌ها (Sample QC) آغاز می‌شود تا از مطابقت آن‌ها با الزامات فنی روش RNA-Seq اطمینان حاصل گردد. پس از آن، متناسب با نوع موجود زنده و اهداف تحقیقاتی، کتابخانه‌های مناسب تهیه شده و صحت و کیفیت آن‌ها مورد ارزیابی قرار می‌گیرد (Library QC). در مرحله توالی‌یابی، از روش دوطرفه با طول خوانش 150 جفت‌باز (Paired-End 150 bp) استفاده می‌شود و کیفیت داده‌های حاصل نیز در مرحله کنترل کیفیت داده‌ها (Data QC) بررسی می‌گردد. در پایان، تحلیل‌های بیوانفورماتیکی تخصصی انجام شده و نتایج نهایی به صورت آماده برای ارائه و انتشار در اختیار پژوهشگر قرار می‌گیرد. روند گام‌به‌گام تکنیک mRNA-seq در فلوچارت زیر قابل مشاهده است.
