Isoform Sequencing (Full-length Transcript Sequencing)
توالی‌یابی ایزوفرم (Iso-Seq) با استفاده از فناوری PacBio SMRT (Single Molecule, Real-Time) امکان توالی‌یابی ایزوفرم‌های کامل ترنسکریپت‌ها را از ناحیه 5’UTR تا انتهای پلی‌آدنیله 3’poly-A در ژن‌های هدف فراهم می‌کند. Iso-Seq یک روش با توان عملیاتی بالا برای شناسایی ژن‌های ترکیبی (Fusion Genes)، بررسی جایگزینی‌های اسپلایسینگ، حاشیه‌نگاری ژنوم‌ها و کشف ترنسکریپت‌های جدید است.
کاربردها
● بررسی مکانیسم‌های بیماری
● کشف ترنسکریپت‌های جایگزین به‌عنوان بیومارکرهای بالقوه
● مطالعه مکانیسم‌های مقاومت دارویی
● شناسایی ژن‌ها و ترنسکریپت‌های جدید
● بهبود حاشیه‌نگاری ژنوم برای شناسایی مناطق کدکننده، عناصر تنظیمی و ساختاری ژن‌ها
● درک توسعه گیاهان تحت تنش‌های محیطی
● کشف ایزوفرم‌های جدید ناشی از جایگزینی‌های اسپلایسینگ
مزیت‌ها
● ظرفیت بالای توالی‌یابی، داده‌های باکیفیت، زمان تحویل سریع و قیمت مقرون‌به‌صرفه
● خط لوله پیشرفته برای کشف ترنسکریپت‌های جدید و انجام آنالیزهای بیان تفاضلی و حاشیه‌نگاری عملکردی
● امکان بهینه‌سازی فرایند توالی‌یابی برای دستیابی به طول و خروجی خوانش فراتر از استانداردهای
کیت Kinnex Full-length RNA
کیت‌های Kinnex مبتنی بر روش MAS-Seq هستند که با اتصال آمپلیکون‌های کوچک‌تر به کتابخانه‌های قطعه‌ای بزرگ‌تر، ظرفیت توالی‌یابی را افزایش می‌دهند. Novogene از کیت کامل RNA Kinnex و سیستم PacBio Revio در خط لوله توالی‌یابی ایزوفرم استفاده می‌کند تا ظرفیت توالی‌یابی را بهبود دهد. این قابلیت مطالعات در مقیاس بزرگ را با وضوحی فراهم می‌کند که با توالی‌یابی کوتاه‌خوان RNA دشوار است.
ویژگی‌های خدمت
Specifications: DNA Sample Requirements
| Library Type | Sample Type | Amount | Concentration | RIN (Agilent 2100) |
Purity (Nanodrop TM/Agarose Gel) |
| PacBio Iso-Seq library/ PacBio Kinnex full-length RNA library | Total RNA | ≥ 600 ng | ≥ 40 ng/μL | ≥ 6.5 | A260/280= 1.8-2.2; A260/230= 1.3-2.5; *NC/QC≤2 |
Specifications: Sequencing and Analysis
| Platform | PacBio Sequel IIe | PacBio Revio |
| Library Type | Iso-Seq library | Kinnex Full-length RNA library |
| Recommended data amount | ≥ 15 G subreads data per sample | 5M/ 10M HiFi reads per sample |
| Content of analysis |
With reference genome
Without reference genome
Quantification analysis is available without the aid of short-read mRNA-seq when choosing 10M HiFi reads with Kinnex full-length RNA library.
(Transcript analysis can only be conducted when a reference genome is available.) |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
از آماده‌سازی نمونه و کتابخانه، تعیین توالی خوانش کوتاه و بلند و کنترل کیفیت داده‌ها، تا تحلیل بیوانفورماتیکی، شرکت Novogene خدمات و محصولات باکیفیت و حرفه‌ای ارائه می‌دهد. هر مرحله مطابق با استانداردهای علمی بالا و طراحی دقیق انجام می‌شود تا نتایج پژوهشی با کیفیت برتر تضمین گردد.
