Stereo-Seq

کشف دقیق‌تر روابط فضایی بیان ژن‌ها در بافت‌های FFPE برای درک بهتر بیماری‌ها

Stereo-Seq چیست؟

Stereo-Seq مخفف Spatial Enhanced Resolution Omics-sequencing یک فناوری پیشرفته در زمینه ترنسکریپتومیکس فضایی است که بر پایه تکنولوژی DNA Nano Ball (DNB) توسعه یافته است. این پلتفرم نوآورانه امکان تجزیه و تحلیل ترنسکریپتوم فضایی را در سطوح مختلف با رزولوشن بالا، توان عملیاتی بسیار زیاد و میدان دید گسترده فراهم می‌کند.

با استفاده از چیپ‌های آرایه‌ای الگو‌دار و سیستم Coordinate ID (CID)، تکنولوژی Stereo-seq قادر است RNA پیام‌رسان (mRNA) را مستقیماً از بافت نمونه دریافت کرده و مختصات فضایی دقیق آن را بازسازی کند. این قابلیت باعث می‌شود که ارتباطات پیچیده بین بیان ژن، ساختار سلولی و میکرو‌محیط اطراف آن با دقت بی‌سابقه‌ای مشخص گردد.

کاربردهای تکنولوژی Stereo-seq

مطالعات سرطان: با تحلیل ناهمگونی سلول‌های توموری و میکرو‌محیط تومور در مقیاس تک‌سلولی، مسیرهای نوینی در پیشگیری، تشخیص و درمان سرطان ارائه می‌شود.

علوم اعصاب: با بازسازی سه‌ بعدی ساختار اندام‌ها و تحلیل دینامیک‌های فضایی - زمانی، می‌توان به درک بهتری از اتصال‌های عصبی و عملکرد مغز دست یافت.

زیست‌شناسی تکوینی: با ردیابی تعاملات سلولی و مسیرهای مولکولی در مراحل مختلف رشد، بینش‌های دقیقی نسبت به سازوکارهای تکوینی حاصل می‌شود.

مزایای Stereo-seq

رزولوشن فضایی فوق‌العاده در سطح سلولی و زیرسلولی

توانایی پوشش نواحی وسیع از بافت در یک بار آزمایش

امکان تحلیل هم‌زمان هزاران ژن با حفظ موقعیت فضایی دقیق آن‌ها

سازگار با انواع مختلف بافت‌ها، از جمله بافت‌های تازه، یخ‌زده و FFPE

افزایش دقت در تفسیر تعاملات سلول-سلول و سلول-میکرو‌محیط

جمع‌بندی

تکنولوژی Stereo-seq با ارائه داده‌های فضایی دقیق و جامع از بیان ژن‌ها، به ابزاری انقلابی در پژوهش‌های زیست‌پزشکی، سرطان‌شناسی، نوروساینس و زیست‌شناسی رشد تبدیل شده است. این فناوری آینده‌نگر، درک ما از بافت‌های زیستی را متحول کرده و زمینه را برای اکتشافات علمی و درمان‌های نوین فراهم می‌سازد.

ویژگی‌های خدمت

Sample Requirements

Sample Type Sample Amount Storage Conditions Sample QC Shipping
FFPE
Tissue Block
Sample thickness > 1mm, area < 9mm x 9mm (standard chip) Recommended for samples within 3 years;
after embedding,
store at 4°C
DV200≥30% 4°C or Room
Temperature
FFPE
Tissue Section
10-15 FFPE (5μm thickness) scrolls in 1.5mL tube for sample QC;
4-6 FFPE (5μm thickness) tissue sections, place each FFPE section into a new 50 mL centrifuge tube for library prep
After embedding,
store at 4°C;
RNA QC samples: stored in dry EP tubes;
Formal samples: vertical in slide boxes, avoid contact between slides
DV200≥30% 4°C or Room
Temperature

 

 



Specifications:

Specifications of the Stereo-FFPE technology using advanced spatial transcriptomics techniques.

  Stereo-FFPE
Capture Method Random probe capture
Resolution 500nm
Sequencing Platform BGI DNB-SEQ T7
Read Length PE 25bp+59bp
Recommended Data Amount 2.5G read pairs / 210Gb / 1cm2
Capture Area 1cm × 1cm
Analysis
  • Data QC
  • Mapping and Quantification
  • Dimensionality Reduction, Clustering, and Differential analysis:
  • Graphclust clustering
  • K-means clustering
  • Seurat Analysis:
  • PCA analysis
  • Spatial variable gene expression analysis
  • Clustering and dimensionality reduction analysis
  • Differential Expression Gene Analysis (DEG):
  • DEGs clustering heatmap
  • Spatial distribution of DEGs
  • Violine plot
  • t-SNE and UMAP dimensional reduction visualization
  • Functional Enrichment Analysis:
  • GO enrichment
  • KEGG enrichment
  • Reactome enrichment

مزیت‌های ما

متمایز در قیمت و سرعت

تمایز در کیفیت و قیمت

دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس

بین المللی

کارشناسان بین‌المللی

امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته

هدف

رویکرد تخصصی

حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی

گواهی

گواهینامه

گواهی اصالت از شرکت Novogene

روند کار

bmg

حالا سفارش دهید!

برای ثبت سفارش خدمت Stereo-Seq لطفاً فرم زیر را به درستی تکمیل نمایید.

  • مجموع

شناسه خدمت: bmg-stereo-seq دسته: ,
  • کنترل کیفیت توسط کارشناسان بین‌المللی
  • ضمانت «اصالت» تمامی خدمات و محصولات
  • قیمت منصفانه با منشور حقوق مصرف‌کنندگان BMG
  • صرفه‌جویی در زمان شما با انجام فرایندهای سیستماتیک
با خیال راحت از BMG Biotech خرید کنید!
  • پشتیبانی
  • نماد اعتماد الکترونیکی
  • پرداخت کارت به کارت
  • behparddakht
  • ssl secured

با ما از جزئیات پروژه اهداف تحقیقاتی نیازهای آزمایشگاهی داده‌های پژوهشی برنامه‌ریزی زمانی چالش‌های علمی نتایج مورد انتظار خودتان بگویید!

کارشناسان BMG از مراحل اولیه تا پروسۀ اجرایی و تحویل نهایی در کنار شما هستند.

سبد خرید
پیمایش به بالا