Chip-Seq Sequencing چیست؟
توالی‌یابی ایمونوپریسیپیتاسیون کروماتین (ChIP-seq) امکان تهیه پروفایل‌های ژنومی از اهداف DNA شامل اصلاحات هیستونی، فاکتورهای رونویسی و سایر پروتئین‌های مرتبط با DNA را فراهم می‌کند. این روش، انتخاب‌پذیری ChIP را برای بازیابی کمپلکس‌های خاص پروتئین-DNA با قدرت توالی‌یابی نسل جدید (NGS) ترکیب می‌کند تا توالی‌یابی با توان بالا از DNA ممکن شود.
از آنجا که کمپلکس‌های پروتئین-DNA از سلول‌های زنده بازیابی می‌شوند، می‌توان مقایسۀ سایت‌های اتصال را در انواع مختلف سلول‌ها، بافت‌ها یا تحت شرایط متفاوت انجام داد. شرکت Novogene خدمات توالی‌یابی با کیفیت بالا و راه‌حل‌های جامع بیوانفورماتیکی را برای پروژه‌های ChIP-seq ارائه می‌دهد.
کاربردها
ChIP-seq راه‌حل‌هایی برای تنظیم ژن‌ها ارائه می‌دهد و نیازهای تحقیقاتی متنوعی را برآورده می‌کند، از جمله:
● شناسایی چگونگی تنظیم ژن‌ها توسط فاکتورهای رونویسی از طریق تهیه پروفایل سایت‌های اتصال ژنومی و تحلیل موتیف‌ها.
● بررسی الگوهای اصلاح هیستونی مرتبط با تیمارهای آزمایشی یا شرایط نمونه.
● مطالعه روابط بین پروفایل‌های اپی‌ژنتیکی و تنظیمات رونویسی از طریق تحلیل‌های مشترک.
● استفاده از DNAهای ایمنی پریسیپیتاسیون شده متنوع با روش‌هایی مانند ChIP ،Cut&Tag و غیره.
مزیت‌ها
● با تضمین کیفیت داده‌ها و امتیاز توالی‌یابی Q30≥80%، داده‌های خروجی، پایدار و قابل اعتماد هستند.
● تحلیل بیوانفورماتیکی توسط متخصصان با استفاده از نرم‌افزار استاندارد صنعتی MACS2
● بررسی ارتباط بین داده‌های ChIP-seq و بیان ژن‌ها
ویژگی‌های خدمت
Specifications: DNA Sample Requirements
| Sample Type | Required Amount | Fragment size | Purity |
| Enriched DNA Sample | ≥ 20 ng (Concentration ≥ 2 ng/μL) | 100 bp~500 bp | A260/280=1.8-2.0 |
Specifications: Sequencing and Analysis
| Platform | Illumina NovaSeq 6000 |
| Read Length | Pair-end 150 bp |
| Sequencing Depth | ≥ 20 million read pairs per sample for the species with reference genome |
| Standard Data Analysis |
|
مزیت‌های ما
تمایز در کیفیت و قیمت
دقیق‌ترین و سریع‌ترین سرویس
کارشناسان بین‌المللی
امکانات نوین و فناوری‌های پیشرفته
رویکرد تخصصی
حضور پژوهشگران بیوتکنولوژی
گواهینامه
گواهی اصالت از شرکت Novogene
روند کار
خدمات ChIP-seq شرکت Novogene شامل چهار مرحله است: آماده‌سازی نمونه، تهیه کتابخانه DNA، توالی‌یابی با دستگاه Illumina PE150 و تحلیل داده‌ها با استفاده از pipelineهای بیوانفورماتیکی. تمامی مراحل از جمله کنترل کیفی نمونه، کتابخانه و داده‌های توالی‌یابی به‌صورت دقیق بررسی می‌شوند تا نتایج قابل اعتمادی در اختیار پژوهشگر قرار گیرد.
